Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTCQ00610 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms