Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms