Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH15P55291 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH15P55291 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms