Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms