Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms