Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MSX1P28360 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MSX1P28360 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MSX1P28360 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MSX1P28360 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MSX1P28360 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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