Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PVALBP20472 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms