Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATF3P18847 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATF3P18847 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATF3P18847 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms