Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAV1P15498 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAV1P15498 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAV1P15498 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAV1P15498 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAV1P15498 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAV1P15498 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms