Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PEPDP12955 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PEPDP12955 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PEPDP12955 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PEPDP12955 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PEPDP12955 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PEPDP12955 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PEPDP12955 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PEPDP12955 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PEPDP12955 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PEPDP12955 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PEPDP12955 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PEPDP12955 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PEPDP12955 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PEPDP12955 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PEPDP12955 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PEPDP12955 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PEPDP12955 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PEPDP12955 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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