Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms