Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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