Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJB1P08034 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB1P08034 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms