Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB2P05107 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB2P05107 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGB2P05107 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms