Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ZBED1O96006 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZBED1O96006 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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