Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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