Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB6O95452 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB6O95452 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB6O95452 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB6O95452 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB6O95452 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB6O95452 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB6O95452 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB6O95452 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB6O95452 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB6O95452 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB6O95452 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms