Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EIF3JO75822 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms