Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms