Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms