Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN34H7C241 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms