Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN25C9JDP6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN25C9JDP6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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