Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf58C9J3I9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms