Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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