Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWA8A3KMH1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms