Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms