Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FRMD3A2A2Y4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FRMD3A2A2Y4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms