Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms