Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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