Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms