Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms