Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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