Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms