Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSEQ9UL01 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DSEQ9UL01 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms