Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms