Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLIP2Q9UDT6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLIP2Q9UDT6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms