Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms