Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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SH3BP4Q9P0V3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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