Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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