Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms