Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms