Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MMP26Q9NRE1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms