Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4BQ9NPR2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms