Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIF1Q9H611 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms