Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCO2Q9BYV7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms