Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms