Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms