Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP250Q9BV73 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms