Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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