Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms